病理科成立于1976年，是全院建科最早的科室之一，也是全院骨干科室， 属于国家重点学科。“肿瘤治疗，诊断先行”，北京大学肿瘤医院病理科承担确定肿瘤性质、明确肿瘤分类、提供预后预测指标、分子病理检测及诊断等工作任务，为临床治疗提供依据。近年来年工作量本院外检量6万余例，其中外院会诊病例1.7万余例，分子检测病例近9千例。在消化道肿瘤、肺癌、乳腺癌、淋巴瘤、黑色素瘤等病理诊断领域具有诊断优势。病理科现有工作人员62名，其中高级职称12名(主任医师7名，副主任医师3名，副研究员1名，外聘专家1名)，中级9名，初级9名，具有博士学位者23名，硕士学位7名;技术系列共32名，中级职称7人，初级职称8人，另有技术辅助人员17人。各亚专科专家参与国内或行业多个病理诊断或肿瘤诊治专家共识与指南的制定，包括CSCO肺癌诊治指南、亚太肺癌NCCN指南、原发性肺癌诊疗指南、非小细胞肺癌血液EGFR基因突变检测中国专家共识、肺神经内分泌肿瘤病理诊断共识、结直肠癌病理诊断共识、中国胃肠胰神经内分泌肿瘤病理诊断共识、黑色素瘤诊治共识、乳腺癌病理诊断共识等等。各亚专科专家在国内外多个学术团体中任职达50余项。近五年，我科参与承担了50余项国内外新药临床研究。