美国加州大学旧金山分校Gu等报告，脑脊液(CSF)宏基因组二代测序(mNGS)检测对样本量的要求低，不需要保持细胞的完整性，虽然最初开发用被于诊断神经系统感染，但在细胞学检测和(或)流式细胞术阴性且假阳性风险很低的中枢神经系统(CNS)恶性肿瘤患者中也可以检测CSF中的遗传证据。(JAMA Neurol. 2021 年 9 月 13 日在线版 DOI:10.1001/jamaneurol.2021.3088)

CSF细胞学检测和流式细胞术诊断CNS肿瘤不敏感。为了确定CSF mNGS在难以确诊的CNS恶性肿瘤病例中是否可以识别出非整倍体(恶性肿瘤的标志)，研究者在加州大学旧金山分校(UCSF)进行了两项病例对照研究。

第一项研究使用了2017年7月1日至2019年12月31日在UCSF临床实验室收集的CSF标本，并评估了CNS恶性肿瘤患者(阳性对照)或无CNS恶性肿瘤(阴性对照)患者标本的检测性能，将结果与CSF细胞学检测和/或流式细胞术的结果进行比较。

第二项研究评估了2014年4月1日至2019年7月31日一项正在进行的前瞻性研究中的患者，这些患者呈神经炎症性疾病的表现，但最终被诊断为CNS恶性肿瘤。主要终点为CSF mNGS检测非整倍体的敏感性和特异性。次要子集分析包括CSF和肿瘤组织染色体异常的比较，以及与检测性能相关的神经影像学特征的识别。

结果显示，两项研究共包括130例患者，中位年龄57.5岁(IQR：43.3~68.0岁)，72例(55.4%)为男性。检测性能研究使用了来自47例CNS恶性肿瘤患者和56例其他的神经系统疾病患者的125份实验室CSF残留样本。神经炎症疾病研究招募了12例患者和17例匹配的对照参与者。

CSF mNGS检测的敏感性为75%(95%CI 63%~85%)，特异性为100%(95%CI 96%~100%)。使用非诊断性细胞学和(或)流式细胞术的检测性能研究在64%(95%CI 41%~83%)的患者中检测到非整倍体，在神经炎症疾病研究内最终被确诊为CNS恶性肿瘤的患者中为55%(95%CI 23%~83%)。在非整倍体患者中，38例(90.5%)呈多拷贝数变异，肿瘤比例为31%~49%。

(编译 张书语)