美国研究者Schafer等报告，在非洲血统和欧洲血统的男性前列腺癌患者中，某些蛋白质基因组学特征与该疾病较高的转移风险和（或）复发风险相关。欧洲血统患者对比非洲血统患者，肿瘤中蛋白质丰度和拷贝数改变（CNA）之间具有更强的相关性，表明CNA改变具有功能差异。（2024年AACR年会. 摘要号LB285/1）

蛋白质组学和基因组学相结合的研究是一个被称为蛋白质基因组学的研究领域。蛋白质基因组学研究的优势在于它可以同时检查DNA和蛋白质，以帮助了解错误发生在哪里。因为每个人的DNA都略有不同，这有望使人们对前列腺癌有更精确的了解。

前列腺癌的基因组图谱因患者血统来源而异，但很少有研究对比非洲血统和欧洲血统匹配的患者队列中蛋白质基因组学特征与全面的临床病理数据和长期随访结局。

该项多组学分析自美国军队卫生系统纳入57例非洲血统和55例欧洲血统的、有平等机会接受治疗的前列腺癌患者组织标本构成了一个队列，使用全基因组深度测序技术、基于蛋白质组学和磷酸蛋白质组学的定量质谱技术进行分析。

结果显示，在基因组谱、差异化的蛋白质组谱和磷酸蛋白质组谱中，发现了血统相关的体细胞突变特征，包括单核苷酸变异（SNV）、结构变异（SV）、插入缺失（InDel），以及复发性SNV和CNA。

17p13缺失和1p36扩增的最大检出率分别见于欧洲血统和非洲血统的肿瘤样本中。在欧洲血统肿瘤样本的3p、17p和18q染色体上，在非洲血统肿瘤样本的1q、3q、5q、13q和19p染色体上，驱动基因的SNV和CNA改变均更常见。

蛋白质组学分析发现，在非洲血统肿瘤样本中，调节雄激素信号传导、脂肪酸氧化和异生素代谢的途径均上调。研究者鉴定并验证了一个ERG反应蛋白组，该蛋白组能显著区分出TMPRSS2-ERG融合和ERG表达。

单变量分析发现了与更高的术后生化复发（BCR）和（或）转移风险相关的、蛋白质表达和复发性CNA的新特征。非洲和欧洲患者肿瘤中某些与生化复发和转移风险相关的蛋白表达水平存在差异。例如，氧化磷酸化途径中的几种NADH:泛醌还原酶亚单位蛋白（如NDUFS8和NDUFV3）在非洲血统患者的肿瘤中表达水平较高，胆固醇代谢途径中的几种载脂蛋白（如APOB和APOC1）在欧洲血统患者的肿瘤中表达增加。在欧洲血统患者的样本中，与衰老相关的突变信号更高；非洲血统患者的样本中，与DNA修复缺陷相关的信号表达更高。

研究者表示，这些血统来源的差异和基因突变特征的变化可以部分解释为什么一些癌症比另一些癌症更具侵袭性，并可以揭示癌细胞的弱点，这些癌细胞可以作为治疗的目标。

该研究的局限性包括样本量相对较小，以及每个队列中患者平均诊断年龄之间的不平衡性，因为纳入的非洲裔男性往往在更年轻的时候就被确诊。此外，肿瘤样本来自早期疾病患者，因此研究结果没有反映出晚期或转移性前列腺癌中所见的更多样的突变特征。

（编译 郑嘉瑞）