非小细胞肺癌EGFR突变的检测 PE-cfDNA可补充血浆和肿瘤组织的基因分型
香港中文大学临床肿瘤学系Lee等报告,在非小细胞肺癌(NSCLC)患者中,胸膜积液和心包积液中cfDNA的基因分型(PE-cfDNA)可准确检出EGFR突变情况。与指南推荐的PE细胞块制备物相比,在PE-cfDNA中能检出更多的EGFR T790M。(JAMA Oncol. 2022年12月29日在线版)
NSCLC的分子检测常因肿瘤样本不足而受限。血浆中游离DNA(cfDNA)基因分型是一种补充性检测,虽有特异性但敏感性仅为中度。PE-cfDNA可以进一步优化分子诊断的应用并减少重复活检。
为了前瞻性验证液滴数字聚合酶链缓解(ddPCR)检测PE-cfDNA中EGFR敏感性突变和Thr790Met获得性突变(T790M)的可行性,该项前瞻性诊断验证研究于2016年9月6日至2021年1月21日在香港两大癌症中心进行,随机招募了携带野生型和变异型EGFR的、有渗出性胸膜积液和心包积液的晚期NSCLC患者(接受了胸腔穿刺术或心包穿刺术),进行胸膜积液/心包积液和血液取样开展ddPCR EGFR检测。
患者被分为EGFR酪氨酸激酶抑制剂(TKI)未治疗队列(队列1)和未接受奥希替尼的EGFR-TKI治疗队列(队列2)。PE-cfDNA和血液的ddPCR检测的EGFR状态结果与匹配的肿瘤活检或PE细胞块样本的EGFR状态进行比较。
结果显示,纳入171例患者(54%为女性),其中队列1有104例,队列2有67例。在队列1中,37%(38/102)为EGFR突变阳性;PE-cfDNA检测EGFR敏感性突变的敏感性为97%(95%CI 92%~100%),特异性为97%(95%CI 93%~100%),一致性为97%(κ=0.94,P<0.001)。在检测EGFR敏感性突变方面,PE-cfDNA比血浆更敏感(97% vs. 74%,P<0.001)。
在队列2中,38%(15/40)为EGFR T790M阳性;PE-cfDNA检测获得性T790M的敏感性为87%(95%CI 69%~100%),特异性为60%(95%CI 41%~79%),一致性为70%(κ=0.42,P=0.004)。在PE-cfDNA样本和PE细胞块样本中,EGFR T790M突变的检出率分别为51%和25%。
(编译 王博宇)