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CDKN2A基因拷贝缺失定量检测方法获得中国和美国发明专利授权
近日，由病因学研究室邓大君教授等申报的国际发明专利“定量检测人CDKN2A基因拷贝缺失的方法、引物及其用途”获得了美国专利局的授权（专利号US20220275454B2）。该专利在2024年6月4日亦获得中国专利授权（专利号CN201980096165.4）。
CDKN2A/P16基因不仅会通过DNA甲基化途径发生表观遗传失活，还会通过体细胞基因拷贝数缺失（SCNdel）途径失活。在人泛肿瘤基因组中CDKN2A/P16是拷贝数变异频率最高的肿瘤抑制基因，在食管鳞癌中该基因SCNdel的发生频率高达65%。然而因为DNA片段缺失位置多样，目前对肿瘤抑制基因拷贝数缺失研究和认识非常不足，导致包括CDKN2A基因在内的各种肿瘤抑制基因的便利、可靠的检测方法缺乏，临床转化研究受阻。
邓大君教授研究团队长期研究该基因失活与肿瘤发生发展的关系及其应用研究，近年他们在肿瘤细胞基因组CDKN2A基因拷贝缺失规律、生物学意义、临床检测方法建立、临床用途等方面取得了新的突破。他们发现在CDKN2A基因发生拷贝缺失的人类肿瘤中，超过95%的样品存在一个5.1kb的共同缺失序列；该序列的缺失可导致该基因编码的2个蛋白P16(ink4a)和P14(arf)完全缺失和截断突变。以该共同缺失序列为靶标，他们创建了定量PCR法测定该基因拷贝数的新方法（P16-Light，Front Oncol 2022, 12: 1038380；国际发明专利授权）。通过与国家癌症中心魏文强教授合作开展多中心前瞻队列研究，他们发现CDKN2A SCNdel会显著增加癌前病变食管鳞状上皮异型增生的癌变风险；还意外发现该基因还会发生拷贝扩增（SCNamp），能够显著促进食管癌前病变消退（Chinese Med J 2024, 137: 980-989）。他们还发现胃癌组织的CDKN2A SCNdel促进胃癌细胞增殖和侵袭及血行转移（Front Oncol 2021, 11: 801219），而切缘非癌组织的CDKN2A SCNamp则明显降低胃癌转移风险，延长患者总生存时间（Gastric Cancer 2024, 27:986-997）。这些结果说明CDKN2A基因拷贝数变异发生在细胞癌变早期，在判断癌前病变癌变潜能和肿瘤复发转移上有重要临床应用前景。
目前邓大君教授研究团队正致力于CDKN2A拷贝数变异体外诊断试剂盒的开发工作，以期早日服务于临床患者。
