全基因组ctDNA测序可用于乳腺癌检测
英国伦敦癌症研究所Turner等报告,一项基于分子残留病(MRD)的全基因组测序能检测乳腺癌复发,其领先时间(lead time)比临床复发要长,并且与无复发生存期强烈相关。诊断时ctDNA检出率高于基于外显子组测序的肿瘤检测报告。(Ann Oncol. 2025年2月4日在线版)
基于循环肿瘤DNA(ctDNA)的MRD检测提供了一种识别复发高风险患者的策略。在此,研究者用一个超敏感的、基于全基因组测序的、知晓肿瘤信息的ctDNA平台来分析早期乳腺癌患者。
该研究分析了78例患者的617份血浆样本(23例三阴性乳腺癌,35例HER2阳性,18例HR阳性,2例未知),在治疗前的诊断时、新辅助化疗(NAC)的第2周期、新辅助治疗手术后(如可行)、第一年的每3个月、之后每6个月都进行样本采集,使用NeXT个人MRD平台分析血浆DNA(这是一种肿瘤信息全基因组测序方法,可产生个性化的ctDNA测序面板),追踪每例患者的中位1451个变体。分析MRD检测与临床结局的关系。
以百万之一(PPM)为计量单位,样本中ctDNA的检测水平范围为2.19 PPM至204 900 PPM,中位数为405 PPM,其中39%的所有ctDNA检测在<100 PPM的超低范围内。在诊断时有样本的患者中,98%(49/50)在治疗前检测到ctDNA。
中位随访76个月时,ctDNA检测与未来复发的高风险(对数秩检验,P<0.0001)和总生存期缩短(P<0.0001)相关,从ctDNA检测到临床复发的中位领先时间为15个月(0.9~61.5个月)。100%(11/11)的复发患者发现了MRD,首次MRD检测时ctDNA的中位水平为13.1 PPM。随访期间未检测到ctDNA的患者无复发(64/64)。与基于外显子组测序MRD分析相比,该方法的敏感性和领先时间均有所改善。
(编译 胡一凡)
