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肿瘤组织中普遍存在胚系变异

发表时间:2015-12-17

    美国纪念斯隆凯特琳癌症中心的Mark Robson等报告,肿瘤组织-正常组织对比测序法显示肿瘤患者个体中普遍存在胚系变异,可能有助于揭示胚系变异与未知综合征间的关系。(JAMA Oncol. 2015年11月10日在线版)

    肿瘤基因测序法可发现可能的靶基因,并可改变治疗方法。目前的研究集中在发现肿瘤特异的基因变异上,但是针对组织胚系变异的研究同样有助于治疗手段的探究。为了通过常规临床肿瘤测序法评估肿瘤组织胚系突变的负荷量,该研究在纪念梅隆凯特琳癌症中心入组符合条件进展期癌症患者,给予MSK-IMPACT检测。MSK-IMPACT可检测341个肿瘤组织和正常组织的基因。根据2014年3月至10月1566例经历肿瘤概况调查患者的结果,187个与孟德尔病相关的重叠基因为胚系基因变异。

    研究终点指标包括:187个基因中,有病理意义的胚系基因变异(PPGV)的数量,意义未确定变异的数量;PPGV患者个体在临床相关基因亚组中所占的比例,在已知肿瘤类型基因变异中所占的比例,在明确的二次突变中所占的比例。

    结果显示,1566例患者的平均年龄为58岁,54%为女性。在1566例患者中有246例患者(15.7%,95%CI14.0%~17.6%)携带与孟德尔病相关的胚系变异,其中198例患者携带与肿瘤易感性相关的基因突变。198例患者中只有81例患者(40.9%,95%CI 34.3%~47.9%)的癌症易感性胚系变异与自身的肿瘤类型相符。

    在182例肿瘤组织中具有PPGV的患者中,有39例(21.4%,95%CI 16.1%~28.0%)患者的体细胞存在其他等位基因位点的改变,其中13例患者的此类改变与胚系突变或已知的综合征无关。55例患者(3.5%,95%CI  27.1%~45.4%)存在与癌症无关的孟德尔基因突变。几乎每例患者(1565例;99.9%,95%CI 99.6%~99.9%)均存在一个以上临床意义不明的基因变异。

     (编译 李达)