VIGex基因表达特征或可为免疫治疗的预测标志物
会上报告的研究显示,VIGex基因表达特征或可为免疫治疗的预测标志物,VIGex基因表达特征或可为免疫治疗的预测标志物,提供预测信息与PD-L1和TMB无关,与ΔctDNA结合可提高对免疫治疗疗效的预测作用。(摘要号 2510)
VIGex是一种最初在NanoString平台上开发、通过RNA-seq验证的包括12个基因表达特征(GES)的分类算法。VIGex可将肿瘤样本分为热、中冷(I-冷)和冷三个亚组。在之前的研究中,VIGex定义的热亚组患者在Vall D‘Hebron医院(VH)开展的Ⅰ期ICT临床试验(ESMO2020)中有更好的预后(无进展生存期)。
加拿大多伦多综合医院研究者开展了INSPIRE临床试验(NCT02644369),探讨VIGex预测帕博利珠单抗治疗效果的性能,并将VIGex与其他可预测ICT治疗效果的生物标记物进行了比较。
参与该研究的晚期实体瘤患者接受了帕博利珠单抗治疗(200 mg,静脉滴注,q3w)。研究者使用Illumina NextSeq550平台给肿瘤基线样本做了RNA-seq,并使用VIGex算法依据测序数据对肿瘤进行分类。
在基线(B)和治疗第3周期(C3)开始时,检测患者循环肿瘤DNA(ctDNA)。肿瘤突变负荷(TMB)定义为每百万碱基中非同义突变的数量。PD-L1表达采用免疫组化方法进行评估。将热亚组患者与I-冷+冷亚组患者进行比较,然后根据VIGex亚组和与B相比C3时ctDNA的变化(ΔctDNA)的组合定义了4个组。生存时间用Kaplan-Meier法计算,并建立Cox比例风险模型。
研究最终共纳入76例患者(31例男性,45例女性),中位年龄55岁(21~81),ECOG评分0~1,其中高级别浆液性卵巢癌16例,三阴性乳腺癌12例,头颈部肿瘤12例,黑色素瘤10例,其他肿瘤26例。
帕博利珠单抗的中位治疗周期为3(1~35),中位随访期14月(1~67),中位无进展生存期(PFS)10.9个月,中位总生存期(OS)14个月。治疗总缓解率(依据RECIST 1.1判断)热亚组为24%,冷亚组为10%(P=0.22)。
根据肿瘤组织学、TMB和PD-L1表达调整的多变量模型分析显示,热亚组有着较高的OS(HR=0.43,95%CI 0.23~0.81,P=0.009)和PFS(HR=0.48,95%CI 0.25~0.95,P=0.036)。57例患者同时有VIGex和ΔctDNA数据。ΔctDNA的加入进一步提高了VIGex对OS的预测性能。
总的来说,在使用RNA-seq独立外部数据集时,VIGex对ICT治疗作用有很好的预测能力。VIGex提供的预测信息与PD-L1和TMB无关。该研究数据表明,将ΔctDNA与基线VIGex结合或可改进其对ICT治疗作用的预测能力。
(编译 李莹)