无创多靶点粪便DNA甲基化用于胃肠肿瘤早检
2018年,全球估计有480万新发病例和340万死亡病例,胃肠道肿瘤占全球癌症发病率的四分之一以上(26%),占所有癌症相关死亡的三分之一以上(35%)。
尽管美国食品和药物管理局(FDA)已经批准了几种基于粪便的检测和SEPT9基因甲基化血液检测来检测结肠直肠癌,但目前还没有FDA批准的多种胃肠道癌症的早期检测方法。
中国的一项前瞻性研究调查了一种无创、多靶点粪便DNA甲基化检测用于早期发现和定位多种胃肠道癌症的方法,发现该检测可以早期发现和识别胃肠道癌症的起源组织。研究结果在日前于日本举行的2023年ASCO突破会议上报告。(摘要号41)。
研究者前瞻性地招募了124例未接受治疗的胃肠道癌症患者,以及92名每3年接受胃肠道癌症相关检查的健康对照者。胃肠道恶性肿瘤的类型包括结直肠癌、胃癌、食管癌、胰腺癌和壶腹癌。
研究者使用粪便DNA提取试剂盒,从含有5 g新鲜粪便和25 ml留样剂溶液的混合物上清中提取粪便DNA。然后,研究者使用EZ DNA甲基化试剂盒对样本进行亚硫酸盐转化,然后使用粪便DNA多靶点甲基化测定试剂盒对其进行处理,以定量聚合酶链反应检测粪便DNA三个靶点区域的甲基化水平,包括PDX1、COL4A2-1和FGF5基因。
根据研究方案的指导原则,阳性结果定义为三个基因中的任何一个的ΔCt值[ΔCt=Ct(靶基因)-Ct(GAPDH)]<10。构建单个胃肠道肿瘤的多重logistic回归模型,包括每个基因的?Ct值,以校正胃肠道肿瘤的起源组织。
总体而言,124例患者中有98例(79%)癌症检测呈阳性,92名健康对照者中有88名(96%)检测呈阴性。按癌型分,结直肠癌(24/34)、胃癌(19/23)、食管癌(18/24)、胰腺癌(17/21)和壶腹癌(20/22)的阳性率分别为71%、83%、75%、81%和91%。
研究者还发现,在4名阳性健康对照者中,3人被诊断为晚期腺瘤,1人是孕妇。多元logistic回归模型对结直肠癌的敏感性为88%(30/34),胃癌为91%(21/23),食管癌为88%(21/24),胰腺癌为90%(19/21),壶腹癌为95%(21/22)。
研究者总结道指出,多靶点粪便DNA甲基化分析可以在早期准确地检测和识别胃肠道癌症的起源组织。
(编译 高媛)