基因组分析揭示胰腺腺泡细胞癌的种系易感性和同源重组缺陷
美国纪念斯隆·凯特林癌症中心Mandelker等报告的一项大型泛癌症队列显示,胰腺腺泡细胞癌(PACC)被确定为BRCA2种系致病变异和HRD基因组特征患病率最高的癌症类型,这表明PACC应被视为BRCA相关恶性肿瘤谱系的一部分。(J Clin Oncol. 2023年8月22日在线版)
该研究的目的是探讨PACC的遗传易感性及其基因组特征;使用美国食品和药物管理局授权的匹配肿瘤/正常测序法对28 780例癌症患者进行了体细胞和种系分析,其中49例被诊断为PACC。对于一部分PACC患者,研究者进行了全基因组测序(WGS;12例)和RNA测序(6例)。
49例PACC中有18例(36.7%)携带同源重组(HR)和DNA损伤反应(DDR)基因的种系致病变异,包括BRCA1(1例)、BRCA2(12例)、PALB2(2例)、ATM(2例)和CHEK2(1例)。31例PACC显示为单纯的腺泡细胞组织学类型,18例PACC为携带混合腺泡细胞组织学类型。
31例纯PACC中有15例(48%)携带影响HR相关/DDR相关基因的种系致病变异。BRCA2种系致病变异(11/31,35%)在纯PACC中的发生率明显高于在胰腺腺癌(86/2739,3.1%;P<0.001)、高级别浆液性卵巢癌(67/1318,5.1%;P<0.001)、前列腺癌(116/3401,3.4%;P<0.001)、乳腺癌(79/3196,2.5%;P<0.001)中的发生率。
在进行WGS的12例PACC中,有7例检测到HR缺陷(HRD)的基因组特征,包括所有6例存在种系HR相关致病性突变的PACC患者,6例HR相关基因缺乏已知致病性改变PACC患者中的1例。探索性分析显示,在PACC中,所有的体细胞驱动遗传改变和高结合亲和力的新抗原的负荷情况,均受HR相关/DDR相关基因和/或HRD的种系致病改变的影响。
(编译 高媛)