在非小细胞肺癌中鉴别肺内孤立原发还是转移病灶在临床上仍是一个重要难题。美国梅奥诊所Stephen J. Murphy的一项研究中应用第二代DNA基因组测序法，研发了一种染色体重排的技术用于多原发灶和转移灶进行鉴别。（J Clin Oncol.2014年11月10日在线版）

从已知的存在孤立的原发病灶或者肺内转移灶的肺癌患者中收集肿瘤样本进行lineage test development（系谱测试研发）研究，以后再应用于多病灶的肿瘤中。用荧光显微镜分别观察每个肿瘤，用全基因组原位扩增的方法分离基因组DNA；通过亿明达（Illumina）公司的配对文库直接进行第二代DNA基因组测序，把测序结果绘制到人类基因组中去，并用跨越融合连接区的引物进行PCR验证。

41个肿瘤样本（33例为腺癌，8例为鳞癌）测序中，发现每个肿瘤都存在3-276个不等的断点。在预测肺癌中是否为独立的原发肿瘤时，不同病理亚型中不共享任何基因组重排。在所有患者中，每个患者的肺原发灶和转移灶的基因组重排是相同的，强调了染色体断点对特定患者是特异的。多病灶腺癌和鳞癌的样本分别由两名肺部病理专家进行鉴定。大部分样本的组织学和基因学数据是一致的。有差别的样本通过基因组测序帮助解决。

研究结果显示：基于Illumina公司配对测序的基因组重排技术建立的诊断系谱测试体系，被证明在肺癌中鉴别肺内独立原发灶和转移灶是有前景的。

哈尔滨医科大学附属肿瘤医院 陈公琰教授述评：

对肺内多原发病灶和肺孤立原发灶伴有肺内转移灶的鉴别一直是临床上的难题，既往基于影像学上的形态变化加以判断，准确性值得怀疑，随着基因测序技术的进步，Illumina公司创立的染色体重排技术可能成为今后鉴别这类疾病的一项重要方法。