北京市肿瘤防治研究办公室（以下简称“北京肿瘤防办”）成立于1976年，由北京市卫健委领导，挂靠北京大学肿瘤医院，前身是成立于1969年的北京市肿瘤协作组，是北京市卫健委9个慢性病防治办公室中成立最早的一个。目前下设肿瘤登记随访和癌症筛查两个组。肿瘤登记随访组负责北京市户籍人口中全部新发恶性肿瘤病例的登记报告工作，自1977年起收集资料，目前依托高效便捷的信息化网络系统，为政府提供准确可靠的肿瘤发病及死亡信息。北京市癌症发病和死亡数据先后四次被国际癌症研究中心(IARC)《五大洲癌症发病率》收录，随访数据被全球癌症生存项目(CONCORD)收录。标志着北京市肿瘤监测数据质量得到国际同行专家的广泛认可，已达到世界前列水平。癌症筛查项目组于2012年开始承担国家重大公共卫生服务项目城市癌症早诊早治项目和农村结直肠癌和肺癌早诊早治项目，在全市16个区开展肺癌、乳腺癌、肝癌、上消化道癌和结直肠癌的筛查和早诊早治工作。曾获得“国家城市癌症早诊早治项目最佳现场组织奖”等。 近年来，北京肿瘤防办科室发展迅速，目前员工8人。