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高级别浆液性卵巢癌的预后基因表达谱分析

发表时间:2020-06-17

    美国南加州大学Millstein等发现,一种基因表达谱可预测高级别浆液性卵巢癌患者的2年和5年总生存,这种由101种基因组成的表达谱预测效能优于年龄和分期,五分位患者的中位总生存分别为9.5、5.4、3.8、3.2和2.3年。与总生存相关性最强的5种基因分别为TAP1、ZFHX4、CXCL9、FBN1和PTGER3。(Ann Oncol. 2020年5月27日在线版 doi: 10.1016/j.annonc.2020.05.019)

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    高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)女性的中位总生存期(OS)约为4年,但患者之间的生存差异较大。尚无与预后相关的公认的基因表达特征。该研究的目的是为HGSOC患者的总生存期建立可靠的预后标志。

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    从来自多项研究的3769例HGSOC女性患者的福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)肿瘤组织中,使用NanoString技术测量了从1455种肿瘤的荟萃分析中选择的513个基因表达。用弹性网型正则化进行生存分析,以开发5年OS的预后模型,15项研究中的2702个肿瘤样本被纳入训练集,6项研究中的1067个肿瘤样本被纳入独立评估。

    在校正协变量的单基因分析中,276个基因的表达水平与OS相关[错误发现率(FDR)<0.05]。前五位的基因是TAP1,ZFHX4,CXCL9,FBN1和PTGER3(P<0.001)。表现最好的预后标志包括101个基因,这些基因富集于有治疗意义的途径中。基因表达评分(GES)每增加一个标准差,死亡风险就会增加两倍以上(HR=2.35,P<0.001)。根据GES五分位数分层的中位生存期分别为9.5年、5.4年、3.8年、3.2年和2.3年。

    (编译 张丽娜)