“热门话题”BRCA基因检测的最新研究
一项最新研究显示,新型多基因组检测技术不仅能提供乳腺癌风险信息,其评估BRCA1/2有害突变的准确性也与单独检测BRCA相当。(美国乳腺外科医师协会第16届年会)
研究细节
共966例患者的数据在同一机构的三个部门进行回顾性分析,其中337例患者接受全基因检测,629例只检测BRCA突变。
进行全基因组检测和只进行BRCA检测的女性患者间,BRCA1/2突变检出率没有统计学差异(3.6% vs 4.0%)。同样,两组对BRCA基因意义未明变异(VUS)的检出率也没有统计学差异(3.3% vs 4.0%)。
这是一个爆炸式发展领域中的热门话题,加州拉古纳山和奥兰治Breastlink诊所肿瘤外科专家、本研究作者Nimmi S.Kapoor博士表示,这方面检测正在飞速发展。
Kapoor博士指出,这一先进技术能实现高速测序,而对遗传与乳腺癌关系认识的进步则提示BRCA1/2之外的基因突变亦参与其中。随着2013年最高法院对分子病理协会与Myriad遗传公司之间诉讼的裁决,面临遗传性乳腺癌或卵巢癌风险的女性现在可以直接进行包括BRCA1/2在内的多基因组检测,而不是先检测BRCA1/2再测序。
Kapoor博士表示,但是有个大问题,当拥有新的检测方法时,我们需要知道它们是否安全,我们是否遗漏了突变?我们是否还在重复检测老方法已发现的突变?如果真的检出其他基因,我们能得到什么?
检出更多突变
为了评价原先限制性基因检测方法与全新多基因检测之间致病性BRCA1/2突变与VUS的检出率,Kapoor博士和同事回顾性分析了2008年1月至2014年9月间966例接受基因检测患者的数据。
所有女性均由乳腺科医师和(或)风险评估顾问评估是否符合NCCN指南制定的基因检测标准。该研究对比了进行单纯BRCA1/2检测——包括多位点检测(Ashkenazi组)或全BRCA测序、伴或不伴大型重排检测(限制性检测组),与进行多基因组检测——包括至少5种乳腺癌相关基因BRCA1、BRCA2、PTEN、TP53、CDH1及多达28种癌症相关基因的测试结果。
两组间BRCA检出情况没有统计学意义,因此我们的检测是安全的,Kapoor博士说道。
多基因检测组中3.9%(14例)的患者还发现携带非BRCA致病性突变,更有13.4%携带非BRCA意义未明变异。多基因检测组中PALB2、CHEK2、MUTYH和ATM是最常见的非BRCA突变(10例;2.8%)。ATM基因中非BRCA VUS的出现频率最高。
Kapoor博士表示,我们从中发现一些已经熟识的基因突变,如最近《新英格兰医学杂志》报道的PALB2基因,它与乳腺癌及胰腺癌风险相关。我们也找到了之前并不了解的突变,像CHEK2和ATM,它们增加疾病风险,但还没有被深入研究。
然而重要的是,这些新近发现的基因变异可能为癌症风险留下不少悬而未决的问题。“变异性和未知性是这种检测的主要问题,”华盛顿大学医学院普外科副教授Julie A. Margenthaler博士评论道,BRCA突变阳性有NCCN指南指导我们如何处理,但其他突变如CHEK2和ATM并没有完善的指南。进入未知领域对于患者和提供检测的医生都是可怕的,我个人认为提出这些问题很重要,如果不提出来就永远得不到答案。
(编译 吴大维 审校 李俏 徐兵河)
中国医学科学院肿瘤医院
李俏教授、徐兵河教授述评:
BRCA检测是目前备受关注的话题,而这篇研究所评价的多基因检测技术同以往的技术相比,除了能够准确进行BRCA突变的检测之外,还能带给我们许多其他基因的信息,而其中一些我们还不了解它们与疾病的相关性,这些都有待进一步的基因功能研究为我们解答。