对不论是否有BRCA1/BRCA2基因突变的患者进行全基因组测序后，Foley等报告的研究显示，在无BRCA突变的患者中发现了癌症风险相关的潜在致病变异型。该研究结果一方面强调了应完善有癌症家族史患者的潜在风险评估，另一方面，指出正确向这些患者提出忠告的重要性。（自ASCO Post.网站）

研究方法

研究者从德克萨斯大学西南医学中心的癌症遗传学门诊和俄亥俄州立大学癌症遗传学项目中招募了258例患者，并分别采集BRCA1突变（88例）或BRCA2突变（88例）和BRCA1/2均未突变（82例）患者的血液样本进行全基因组测序。首批评估176例独立的BRCA突变携带者（高乳腺癌和卵巢癌风险患者），用以判定全基因组测序结果是否与临床诊断突变结果相符。所有统计学结果都运用了R软件进行统计学分析，95%置信区间则通过二项式概率确定。

研究结果

在BRCA1/2队列中，研究者发现全基因组测序正确识别了大多数临床诊断的BRCA1突变（89.3%）和BRCA2突变（88.6%）。初步分析163例临床相关的潜在致病变异型也显示出全基因组测序可提供有力的临床结论。

虽然功能缺失变异只代表一小部分潜在的致病变异型，但研究者扩大分析了来自ClinVar的3209份数据后，全基因组测序仍可识别已知BRCA1/2突变患者其他癌症风险相关的潜在的功能缺失致病变异型，并诊断出21%的非BRCA突变患者。

总之，研究者表示，全基因组测序为20.7%的非BRCA1/2突变患者提供了潜在致病变异的风险预估。对比而言，近期一项靶基因批量检测的研究仅为10.6%的非BRCA1/2突变患者提供相似的癌症风险评估。该研究作者表示，在将全基因组测序引入临床过程中仍存在其他重大挑战，包括，突变的外显率、如何更好地理解知之甚少的基因及怎样依据上述基因已知的常见突变型的检测结果向患者提出忠告（如CHEK2,PALB2或RAD51C）。

德克萨斯州大学西南医学中心Theodora Ross教授表示，在癌症遗传学诊所做全基因组测序在当下虽然是不合适的，但在未来却是大势所趋。另一方面，全基因组测序不仅旨在识别初次诊断时患者的遗传风险，也能识别其他情况下的患病风险，故遗传咨询意义重大。

预期步骤

Ross教授表示，研究者正在向国立卫生研究院基因型和表型数据库提交全基因组测序数据，以便其他研究者进行分析和发表其研究结果。Ross教授还希望德克萨斯州西南医学中心癌症遗传学中心每年可同期进行超过2000人的全基因组测序。此外，她计划将全基因组测序用于患有癌症易感综合征的“神秘患者”，检测其新的基因突变。

最重要的是，应将对单一基因的研究放在首位。对此，Ross教授表示，问题的关键在于目前对于基因组中各个基因的基础研究甚少，且只有他们团队正致力于发现所有断裂基因。

（编译 海洋 审校 卢铀）