国人研究描绘弥漫型胃癌的蛋白质组全谱
北京蛋白质组研究中心秦钧等对弥漫型胃癌进行了研究分析,首次描绘了弥漫型胃癌的蛋白质组全谱。(Nat Commun. 2018, 9 :1012. doi: 10.1038/s41467-018-03121-2)
研究者团队自2012年起,开启了绘制首个弥漫型胃癌蛋白质组学图谱和肿瘤驱动基因突变图谱的征程。2016年6月,科研团队基本完成84对胃癌与癌旁组织样品的质谱测量工作,共鉴定到274种肿瘤驱动基因的11340种基因产物和突变信息,这些蛋白质覆盖了肿瘤细胞及肿瘤微环境所有可能表达的蛋白,首次描绘了弥漫型胃癌的蛋白质组全谱。
研究者对84例弥漫型胃癌患者进行了分析,根据蛋白组学改变可将弥漫型胃癌分为三个亚型(PX1~3),不同亚型患者总生存时间和对化疗敏感性不同。PX1和PX2有细胞周期调节异常,PX3型免疫反应蛋白表达较高,预后最差,对化疗不敏感。研究者还筛选出23个与患者预计生存时间密切相关的胃癌候选蛋白药物靶标,针对这些靶点可能研发出有效的胃癌靶向治疗药物。有四种主要的异常可用于靶向治疗,也可免疫治疗,尤其是PX3型患者。
弥漫型胃癌被称为“胃癌中的胃癌”,目前尚无有效的靶向疗法。中国胃癌每年新发病例约为68万例,占全球发病病例的一半左右。这种蛋白质组分型不依赖于任何基因组信息,体现出作为功能直接执行者的蛋白质在临床科学中所提供信息的重要性和全面性,可为胃癌的精准医疗提供直接依据。
秦钧指出,大家熟悉的基因测序只能为肿瘤的精准医疗提供非常有限的线索,这个困惑现在可以在蛋白质层面上解决,将来在临床上,对肿瘤进行蛋白质组分析,就可以知道这是哪种肿瘤,应采取哪种治疗方法,不应采取哪种治疗方法。
(编译 冯然)
