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透明细胞子宫内膜癌基因测序揭示了体细胞突变谱

发表时间:2017-06-02

    美国马里兰国家人类基因组研究所的Le Gallo M等报告的一项研究显示,透明细胞性子宫内膜癌(CCEC)、浆液性子宫内膜癌(SEC)和子宫内膜癌(EEC)有着相似的分子机制,并暗示TAF1可能是CCEC新的候选驱动基因。(Cancer. 2017年5月9日在线版)

    CCEC作为一个预后相对不良的病理类型,其分子发病机制至今没有确定。在一个大样本队列研究中,研究者对CCEC患者进行全外显子测序,从而发现新的体细胞突变基因,并评估了已知和候选驱动基因的突变图谱。

    研究者对16例CCEC患者(12例CCEC患者以及4例混合病理类型的CCEC患者)的肿瘤细胞和正常细胞的DNA进行了全外显子测序。对另外47例CCEC患者的22个基因通过Sanger法来测序。微卫星不稳定性(MSI)和微卫星稳定性(MSS)由5个单核苷酸重复序列的基因分型来决定。

    2个肿瘤外显子与高负荷突变和MSI相关。其他14个肿瘤外显子为MSS,在222个编码蛋白的基因中,存在236个非同义性突变或剪接连接体的体细胞突变。在63例CCEC患者体内,发现了以下基因突变的频率:TP53(39.7%)、PIK3CA(23.8%)、PIK3R1(15.9%)、ARID1A(15.9%)、PPP2R1A(15.9%)、SPOP(14.3%)、TAF1(9.5%)、MSI(11.3%)。8例TAF1突变中的5例位于推测的组蛋白乙酰转移酶结构域内,并包含2个反复突变的残留。根据MSI模式和7个突变基因,CCEC分子亚型类似于SEC或EEC。

    (编译 马可心 审校 张为远)