间皮瘤患者应该进行基因测序
爱尔兰研究者Bueno R等报告的一项研究显示,间皮瘤基因测序对于患者的治疗及预后具有重要意义。根据216例间皮瘤患者肿瘤标本的基因检测结果,该研究建立了这种罕见肿瘤的基因突变谱;发现10种有意义的胸膜间皮瘤基因突变以及包括SF3B1和TRAF7在内的复发突变;而其中一些突变对该病的诊断和治疗非常有帮助。(Nat Genetics. 2016; DOI: 10.1038/ng.3520)
研究详情
恶性胸膜间皮瘤通常起病于环境中的石棉暴露问题。美国每年大约有3200人被诊断为间皮瘤,该病每年的死亡人数也与此接近,患者的5年生存率仅为5%~10%。大约4/5的病例与石棉暴露有关。研究者们分析了216例胸膜间皮瘤患者的转录子(211份)、全外显子(99份)和靶外显子(103份);鉴定出了4种不同的间皮瘤分子亚型:即肉瘤样、上皮样、双相上皮样和双相肉瘤样。外显子分析结果显示,BAP1、NF2、TP53、SETD2、DDX3X、ULK2、RYR2、CFAP45、SETDB1和DDX51是有意义的基因突变(q-score≥0.8),SF3B1(2%,4/216)和TRAF7(2%,5/216)等几个基因与复发相关。
SF3B1突变样本的剪接形式不同于野生型肿瘤。TRAF7替换主要发生在WD40结构域,并于NF2替换互斥(仅1例例外)。复发基因融合和剪接形式改变是NF2、BAP1和SETD2失活的常见机制。此外,还存在Hippo通路、mTOR通路、组蛋白甲基化、RNA解螺旋酶和p53信号通路的改变。研究者认为:这些结果大致阐述了既往基因研究结果,并提供了间皮瘤基因框架。针对胸膜间皮瘤患者开展包含有意义突变的基因探测分析,将有利于开展合理的个体化治疗
此外,211例肿瘤标本中有83例为PD-L1阳性,PD-L1最常表达在预后极差的肉瘤样肿瘤中,为今后免疫治疗的开展提供了方向。
研究者说
Bueno表示:这是目前规模最大和范围最广的胸膜间皮瘤基因分析研究,它确立了间皮瘤基因突变谱,其中一些基因是以前已知的,另一些则是以前未知的。即使这些突变仅存在于一小部分间皮瘤患者中,这些发现仍将改变目前的治疗策略。需要考虑的是,检测间皮瘤基因是否有意义,因为目前没有相对应的靶向治疗,而其他肿瘤基因测序是为了靶向治疗。但该研究结果提示,至少一到两个基因突变有可能成为现有药物研发的治疗靶点。
研究者强调:基因分析的主要新发现是,间皮瘤基因突变特征不同于大部分其他肿瘤,最接近卵巢癌的特性。因为它们都起源于中胚层,特性相近或许不足为奇。另一个非常重要的新发现是,1/3的间皮瘤在RNA水平上被鉴定出存在基因融合,因为如果人们能在血液中发现这些突变,将非常有利于间皮瘤的筛查。
Bueno坚信:临床医生应该意识到对间皮瘤患者开展的基因测序与在其他肿瘤中所做的工作一样重要;即使只有2%、3%或4%测序突变有意义,也能极大地改善一部分患者的预后。
(编译 张明辉 审校 王艳)