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年轻发病结直肠癌(CRC)患者的转录代谢分析

作者: 来源: 发布时间:2023-07-13

罗斯威尔公园综合癌症中心Vadehra报告的一项研究揭示了年轻和老年结直肠癌人群在转录代谢谱和其他疾病驱动因素以及免疫谱方面的差异。这种生物学特性应该在未来治疗年轻结直肠癌人群时作为新途径进行探索。(摘要号 3509)

确诊时年龄<50岁的结直肠癌(CRC)患者通常患有更晚期的疾病,这会导致较差的治疗反应和临床结局。因此,亟需了解年轻(<50岁)和老年(>50岁)CRC患者之间转录谱的差异。

采用癌症基因组图谱(TCGA:397例;>50岁者349例;<50岁者48例)和肿瘤研究信息交换网络(ORIEN)CRC数据集(460例;>50岁者364例;<50岁者96例),研究者将患者分为年轻组和老年组,随后通过差异基因表达分析(DESeq2)、基因集富集分析(GSEA)、免疫反褶积(TIMER2.0)和代谢途径分析(MetaPhOR)对两组患者的转录谱进行比较和评估;然后绘制这些通路以评估转录失调,预测代谢通量的模式。

老年组和年轻组的对比显示了大量表达差异显著的转录物(2629),这些转录物在年轻组患者的代谢途径(氨基酸和脂质)、致癌基因(MYC靶点和NRAS靶点)和细胞学过程中富集。研究发现,甲基化和组蛋白修饰、免疫反应和其他代谢途径(如雄激素)在老年组患者中富集。代谢途径分析显示,类固醇激素代谢和犬尿酸原代谢发生了一致的变化,这两种代谢在50岁以上人群中都大幅上调。此外,在50岁以上人群中,与CTLA4和PD-L1治疗反应相关的通路在很大程度上上调。这种转录特征可能与针对这些通路的药物的不同临床结局和治疗反应的倾向性有关。

(编译 郭青青)