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深度学习人工智能可从组织学切片预测同源重组缺陷和铂反应

作者: 来源: 发布时间:2024-09-02

美国加州大学圣地亚哥分校Bergstrom等报告,通过多个外部队列的苏木精和伊红(H&E)染色常规切片、切片扫描仪和组织固定变量,DeepHRD可以直接预测乳腺癌和卵巢癌的同源重组缺陷(HRD)。与分子检测相比,DeepHRD将1.8~3.1倍多的HRD患者分类,这些患者在高级别浆液性卵巢癌中表现出更好的总生存期(OS),在转移性乳腺癌中表现出更好的铂类特异性无进展生存期(PFS)。(J Clin Oncol. 2024年7月31日在线版)

具有HRD的癌症可以受益于铂剂和多(adp-核糖)聚合酶抑制剂。用于检测HRD的标准诊断测试需要分子谱分析,但这并不是普遍可用的。

该研究使用来自癌症基因组图谱(TCGA)中的原发性乳腺癌(1008例)和卵巢癌(459例)数据,对DeepHRD(一个深度学习平台)进行训练,用于从H&E染色的组织病理学切片中预测HRD。使用来自多个独立数据集的乳腺癌(349例)和卵巢癌(141例)数据,包括以RECIST标准评估PFS、完全缓解(CR)和OS终点的铂治疗的临床队列,DeepHRD与四种标准HRD分子检测进行了比较。

TCGA队列H&E染色后的乳腺癌切片中,DeepHRD预测HRD的受试者特征曲线下面积(AUC)为0.81(95%CI 0.77~0.85)。这一结果在两个独立的原发性乳腺癌队列中得到证实(AUC=0.76,95%CI 0.71~0.82)。

在铂治疗的转移性乳腺癌外部队列中,预测为HRD的样本具有更高的CR(AUC=0.76,95%CI 0.54~0.93),中位PFS延长3.7倍(14.4个月 vs. 3.9个月;HR=0.45,P=0.0047)。

在三个乳腺癌队列中,通过预测的HRD状态发现,不含铂治疗的结果没有显著差异,包括紫杉烷治疗的转移性乳腺癌的CR(AUC=0.39)和PFS(HR=0.98,P=0.95)。

通过对高级别浆液性卵巢癌的迁移学习,DeepHRD预测的HRD样本在一线(HR=0.46,P=0.030)和新辅助(HR=0.49,P=0.015)含铂治疗后有更好的OS。

(编译 杨自在)